在用友软件中设置部门编码的步骤如下：

用友如何设置部门编码

打开基础设置

点击主界面上的“基础设置”菜单。

进入基本信息

在基础设置中，选择“基本信息”选项。

选择编码方案

在基本信息界面，找到并点击“编码方案”链接。

设置部门编码级次

在编码方案界面，选择“部门科目编码级次”选项，这里可以设置部门编码的级次和规则。

通过以上步骤，你可以根据企业的实际情况和需求，设定合适的部门编码规则，确保每个部门编码的唯一性和准确性。

建议：

在设置部门编码时，务必仔细考虑企业的组织架构和层级关系，确保编码规则能够准确反映企业的实际结构。

定期检查和维护部门编码，避免因编码规则设置不当导致信息归类混乱或查询困难。